ASS.Lec. Suad Turky Ali Lec -4- AL-Ma’moon University College Medical Laberatory techniques Department Clinical biochemistry / Second stage ASS.Lec. Suad Turky Ali Lec -4-

Peptide bond formation

Peptide bond formation Polypeptides are linear polymers composed of amino acids linked together by peptide bonds. Peptide bonds are amide linkages between the ά – carboxyl group of one amino acid and the ά – amino group of another. And a water molecule is lost in the reaction, because the reaction is a dehydration. The linked amino acids are referred to as: Amino acid residues. Link : H2N-Tyr-Ala-cyc-Gly-cooh Tyr: Tyrosine , Alanine , cysteine

Formation of dipeptide : a peptide bond forms by the joining the ά – carboxyl group of one amino acid to the amino group of another. A water molecwles is lost in the reaction: For example : H2N – Tyr – Ala – cys – Gly CooH is a tetrapeptide named tyrosylalanylcysteinylglycine. مثلا : اربع احماض امينية Peptide Bond  

Dipeptide : when two amino acid molecules are kinked tripeptide : contains three amino acid residnes. Terapeptide : contains four amino acid residues. And so on . Disul fide bridge : results from oxidation of two molecules of cysteine, the formation is called cystine. Disulfide bridges contribute to the stability of many polypeptides and proteins.

Biological activity of peptides   Biological activity of peptides Many peptides have important biological activities. Such as : tripeptide glutathione the (y – glutamy – l - ) cys teinyl glycine) contains an unusual Y- amide bond found in almost all organisms glutathione is involved in many important biological processes. Among these are protein and DNA synthesis , drugs and environmental toxin metabolism , and amino acid transport one group of glutathione's functions is based on its effectiveness as reducing component of the molecule is (sh) group of the

هناك تقسيم آخر للحوامض الامينية يعتمد على موجود المجاميع الفعالة: هناك تقسيم آخر للحوامض الامينية يعتمد على موجود المجاميع الفعالة: Aliphatic amino acid Aromatic amino acids. Hetero cyclic  

Neutral : with hydrocarbon chain like : L-glucine L-alanine Aliphatic : Neutral : with hydrocarbon chain like : L-glucine L-alanine Sulphur containing (sh) like : tcysleine methoinine Hydroxyl group containing (- COOH) like : L-serine , L-thronine Acidic : contain (2) carboxyl groups like :aspartic acid (L) L-glutamic acid. Basic : containing (2) amine (NH4) Like : L-Lycine L-argennine

Aromatic containing phenyl group : Like : L-phenyl alanine L-hydroxy phenyl alanine. Heterocyclic : containing different cycles : L-tryptophane   Amino acids stereo isomers يلاحظ ان جميع الاحماض الامينية على شكل α عدا حامض الكلايسين clycine تحتوي على ذرة كاربون غير متناظرة او غير متماثلة (asymmetric) وعليه تكون هذه الحوامض الامينية ذات نشاط بصري ، ويقصد في ذلك قابليتها على ادارة مستوى الضوء المستقطب (polarized light)

ان هذه الحوامض الامينية اما ان تكون يمينية الدوران (Dextroro) او يسارية الدوران (levorotatory) في حالة (ph) او الاس الهيدروجيني = 7.0 جميع الحوامض الامينية التي توجد طبيعيا في الانسجة تكون على شكل (L) ولقد وجد شكل (D) في بعض الكائنات المجهرية وكذلك في بعض الاجسام المضادة (antibodies) وفي الانسجة مرض السرطان. ان الحوامض الامينية تنتج في الواقع من التحلل المائي (hydrolysis) للبروتينات وان قسما منها يوجد بصورة حرة في انسجة الجسم حيث تلعب دورا مهما في العمليات الحياتية الوسطية.

ان عملية التحلل المائي الكامل للبروتينات ينتج عنه حوالي (20) نوعا مختلفا من انواع الحوامض الامينية من نوع مجموعة الفا والتي تحتوي على مجموعة امينية (Amino group) قاعدية ومجموعة كاربوكسيلية حامضية (carboxyl group) علما ان كلا المجموعتين السابقتين تتصل الى ذرة الكربون (الفا) او الفا الكاربونية للحامض الاميني. ان تحلل البروتينات الى وحداتها الاساسية الاحادية بالحوامض والقواعد والخمائر بواسطة عملية التحلل المائي لهذه المركبات (البروتينات) hydrolysis هي عبارة عن قطع الاواصر الكيميائية الموجودة في هذه المركبات مع اضافة عنصر الماء لها اثناء العملية. Because , the α – carbon of (19) of the (20) amino acids are attached to four different groups (i.e. a hydrogen , a carboxyl group an amino group and an R group) They are referred to as : A symmetric (The twentieth amino acid , glycine is asymmetrical molecule because its α – carbon is attached to two hydrogens. (أي حامض الكلايبيس متناظر فقط)

THANK YOU